{"id":244542,"date":"2024-07-12T05:30:00","date_gmt":"2024-07-12T05:30:00","guid":{"rendered":"https:\/\/datascientest.com\/?p=244542"},"modified":"2024-08-20T14:17:16","modified_gmt":"2024-08-20T14:17:16","slug":"alphafold-tout-savoir","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/datascientest.com\/alphafold-tout-savoir","title":{"rendered":"AlphaFold : Tout ce qu&rsquo;il faut savoir"},"content":{"rendered":"\t\t<div data-elementor-type=\"wp-post\" data-elementor-id=\"244542\" class=\"elementor elementor-244542\" data-elementor-post-type=\"post\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-cbba37a e-flex e-con-boxed e-con\" data-id=\"cbba37a\" data-element_type=\"container\" data-settings=\"{&quot;content_width&quot;:&quot;boxed&quot;}\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"e-con-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-7350f31 elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"7350f31\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<style>\/*! elementor - v3.15.0 - 02-08-2023 *\/\n.elementor-heading-title{padding:0;margin:0;line-height:1}.elementor-widget-heading .elementor-heading-title[class*=elementor-size-]>a{color:inherit;font-size:inherit;line-height:inherit}.elementor-widget-heading .elementor-heading-title.elementor-size-small{font-size:15px}.elementor-widget-heading .elementor-heading-title.elementor-size-medium{font-size:19px}.elementor-widget-heading .elementor-heading-title.elementor-size-large{font-size:29px}.elementor-widget-heading .elementor-heading-title.elementor-size-xl{font-size:39px}.elementor-widget-heading .elementor-heading-title.elementor-size-xxl{font-size:59px}<\/style><p class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">Les prot\u00e9ines sont des mol\u00e9cules essentielles \u00e0 la vie, jouant un r\u00f4le crucial dans de nombreux processus biologiques. Elles sont pr\u00e9sentes dans toutes les cellules vivantes et remplissent une multitude de fonctions vitales. Elles sont constitu\u00e9es d'acides amin\u00e9s et se d\u00e9ploient dans des structures tridimensionnelles sp\u00e9cifiques qui d\u00e9terminent leur fonction. <\/p>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-d2644c1 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"d2644c1\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<style>\/*! elementor - v3.15.0 - 02-08-2023 *\/\n.elementor-widget-text-editor.elementor-drop-cap-view-stacked .elementor-drop-cap{background-color:#69727d;color:#fff}.elementor-widget-text-editor.elementor-drop-cap-view-framed .elementor-drop-cap{color:#69727d;border:3px solid;background-color:transparent}.elementor-widget-text-editor:not(.elementor-drop-cap-view-default) .elementor-drop-cap{margin-top:8px}.elementor-widget-text-editor:not(.elementor-drop-cap-view-default) .elementor-drop-cap-letter{width:1em;height:1em}.elementor-widget-text-editor .elementor-drop-cap{float:left;text-align:center;line-height:1;font-size:50px}.elementor-widget-text-editor .elementor-drop-cap-letter{display:inline-block}<\/style>\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">Ces structures complexes permettent aux prot\u00e9ines d&rsquo;interagir avec d&rsquo;autres mol\u00e9cules, de catalyser des r\u00e9actions chimiques, de transmettre des signaux cellulaires et de fournir un soutien structurel aux cellules et aux tissus.<\/span><\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-12cd2c0 elementor-widget elementor-widget-image\" data-id=\"12cd2c0\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"image.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<style>\/*! elementor - v3.15.0 - 02-08-2023 *\/\n.elementor-widget-image{text-align:center}.elementor-widget-image a{display:inline-block}.elementor-widget-image a img[src$=\".svg\"]{width:48px}.elementor-widget-image img{vertical-align:middle;display:inline-block}<\/style>\t\t\t\t\t\t\t\t\t<figure class=\"wp-caption\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<img decoding=\"async\" width=\"418\" height=\"235\" src=\"https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/image1-4.png\" class=\"attachment-full size-full wp-image-244545\" alt=\"\" srcset=\"https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/image1-4.png 418w, https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/image1-4-300x169.png 300w\" sizes=\"(max-width: 418px) 100vw, 418px\" \/>\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<figcaption class=\"widget-image-caption wp-caption-text\">Source : <a href=\"https:\/\/deepmind.google\/discover\/blog\/a-glimpse-of-the-next-generation-of-alphafold\/\">A glimpse of the next generation of AlphaFold - Google DeepMind<\/a><\/figcaption>\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/figure>\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-0a4c648 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"0a4c648\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">Cependant, pr\u00e9dire la structure exacte d&rsquo;une prot\u00e9ine \u00e0 partir de sa s\u00e9quence d&rsquo;acides amin\u00e9s a longtemps \u00e9t\u00e9 un d\u00e9fi majeur en biologie et en biochimie. La compr\u00e9hension de cette structure est essentielle, car elle permet de mieux comprendre le <strong>m\u00e9canisme d&rsquo;action des prot\u00e9ines<\/strong> et d&rsquo;\u00e9laborer des strat\u00e9gies pour moduler leur fonction, ce qui est crucial pour le d\u00e9veloppement de nouveaux m\u00e9dicaments et traitements.<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">C&rsquo;est dans ce contexte que se distingue AlphaFold, une avanc\u00e9e r\u00e9volutionnaire dans le <a href=\"https:\/\/datascientest.com\/bioinformatique-tout-savoir\">domaine de la biologie<\/a>.<\/span><\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-76c9693 e-flex e-con-boxed e-con\" data-id=\"76c9693\" data-element_type=\"container\" data-settings=\"{&quot;content_width&quot;:&quot;boxed&quot;}\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"e-con-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-71c108d elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"71c108d\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h3 class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">Qu\u2019est-ce que Alphafold ?<\/h3>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-c84a874 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"c84a874\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">AlphaFold est un programme d&rsquo;<a href=\"https:\/\/datascientest.com\/intelligence-artificielle-definition\">intelligence artificielle (IA)<\/a> cr\u00e9\u00e9 par <a href=\"https:\/\/datascientest.com\/google-deepmind-cree-une-ia-qui-revolutionne-les-algorithmes-de-tri\">DeepMind<\/a>, une filiale de Google sp\u00e9cialis\u00e9e dans l&rsquo;apprentissage profond. AlphaFold utilise des <a href=\"https:\/\/datascientest.com\/fonctionnement-des-reseaux-neurones\">r\u00e9seaux de neurones<\/a> pour pr\u00e9dire avec pr\u00e9cision la <strong>structure tridimensionnelle des prot\u00e9ines<\/strong> \u00e0 partir de leurs s\u00e9quences d&rsquo;acides amin\u00e9s. Cette innovation a le potentiel de transformer notre <strong>compr\u00e9hension des processus biologiques fondamentaux<\/strong> et d&rsquo;acc\u00e9l\u00e9rer les progr\u00e8s en m\u00e9decine et en biotechnologie.<\/span><\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-64f0fd1 elementor-align-center button-principale elementor-widget elementor-widget-button\" data-id=\"64f0fd1\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"button.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-button-wrapper\">\n\t\t\t<a class=\"elementor-button elementor-button-link elementor-size-sm elementor-animation-grow\" href=\"https:\/\/datascientest.com\/formation-intelligence-artificielle\">\n\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-content-wrapper\">\n\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-text\">Se former au d\u00e9veloppement d'une IA<\/span>\n\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-8146a81 e-flex e-con-boxed e-con\" data-id=\"8146a81\" data-element_type=\"container\" data-settings=\"{&quot;content_width&quot;:&quot;boxed&quot;}\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"e-con-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-a4ccdcc elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"a4ccdcc\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h3 class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">Les d\u00e9fis de la pr\u00e9diction de la structure des prot\u00e9ines<\/h3>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-ef59701 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"ef59701\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">La pr\u00e9diction de la structure des prot\u00e9ines repr\u00e9sente un d\u00e9fi consid\u00e9rable en biologie mol\u00e9culaire en raison de plusieurs facteurs complexes.<\/span><\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-82469b9 elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"82469b9\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h4 class=\"elementor-heading-title elementor-size-medium\">1. Diversit\u00e9 des s\u00e9quences et structures :<\/h4>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-692f0a4 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"692f0a4\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">\u00c0 ce jour, plus de 200 millions de prot\u00e9ines sont connues, et de nombreuses autres sont d\u00e9couvertes chaque ann\u00e9e. Chacune d&rsquo;elles poss\u00e8de une forme tridimensionnelle unique.<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">En effet, les prot\u00e9ines sont constitu\u00e9es de 20 types d&rsquo;<strong>acides amin\u00e9s<\/strong> diff\u00e9rents, arrang\u00e9s en s\u00e9quences pouvant varier en longueur et en composition. Cette diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e8re une <strong>multitude de structures tridimensionnelles possibles<\/strong>, rendant la pr\u00e9diction pr\u00e9cise de ces structures extr\u00eamement difficile.<\/span><\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-94b1530 elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"94b1530\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h4 class=\"elementor-heading-title elementor-size-medium\">2. Limites des m\u00e9thodes exp\u00e9rimentales :<\/h4>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-a18ffa4 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"a18ffa4\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">Pour d\u00e9terminer la structure des prot\u00e9ines, il existe diff\u00e9rentes m\u00e9thodes exp\u00e9rimentales telles que la cristallographie aux rayons X ou encore la <strong>r\u00e9sonance magn\u00e9tique nucl\u00e9aire (RMN)<\/strong>. Ces m\u00e9thodes sont n\u00e9anmoins longues, co\u00fbteuses et ne r\u00e9ussissent pas toujours.\u00a0<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">De plus, il existe des prot\u00e9ines pour lesquelles il est difficile, voire impossible, d&rsquo;<strong>obtenir des donn\u00e9es structurelles pr\u00e9cises par des m\u00e9thodes exp\u00e9rimentales traditionnelles<\/strong>. Ces prot\u00e9ines incluent celles qui sont tr\u00e8s grandes, tr\u00e8s flexibles, ou qui ne cristallisent pas facilement.<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">C&rsquo;est pourquoi, pendant des d\u00e9cennies, les scientifiques ont tent\u00e9 de trouver une m\u00e9thode permettant de d\u00e9terminer de mani\u00e8re fiable la structure d&rsquo;une prot\u00e9ine \u00e0 partir de sa seule s\u00e9quence d&rsquo;acides amin\u00e9s.<\/span><\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-034eac9 elementor-widget elementor-widget-image\" data-id=\"034eac9\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"image.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<img decoding=\"async\" width=\"900\" height=\"514\" src=\"https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/alphafold-datascientest1.jpg\" class=\"attachment-full size-full wp-image-244585\" alt=\"\" srcset=\"https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/alphafold-datascientest1.jpg 900w, https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/alphafold-datascientest1-300x171.jpg 300w, https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/alphafold-datascientest1-768x439.jpg 768w\" sizes=\"(max-width: 900px) 100vw, 900px\" \/>\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-24d5f98 e-flex e-con-boxed e-con\" data-id=\"24d5f98\" data-element_type=\"container\" data-settings=\"{&quot;content_width&quot;:&quot;boxed&quot;}\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"e-con-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-c7ef821 elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"c7ef821\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h3 class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">Le succ\u00e8s de AlphaFold<\/h3>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-0efffeb elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"0efffeb\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">La comp\u00e9tition <strong>CASP (Critical Assessment of Structure Prediction)<\/strong> est un \u00e9v\u00e8nement qui se tient tous les deux ans et qui vise \u00e0 \u00e9valuer les m\u00e9thodes de pr\u00e9diction des structures tridimensionnelles des prot\u00e9ines.\u00a0<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">Pour cela, des <strong>structures de prot\u00e9ines nouvellement d\u00e9termin\u00e9es<\/strong> exp\u00e9rimentalement (mais non encore publi\u00e9es) sont s\u00e9lectionn\u00e9es comme cibles. Au cours des semaines suivantes, les diff\u00e9rentes \u00e9quipes participantes doivent fournir les structures de ces prot\u00e9ines pr\u00e9dites par leur m\u00e9thode. Puis, les <strong>pr\u00e9dictions<\/strong> sont compar\u00e9es aux structures exp\u00e9rimentales r\u00e9elles, permettant d&rsquo;\u00e9valuer la pr\u00e9cision des diff\u00e9rentes m\u00e9thodes de pr\u00e9diction.<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">En 2018, <strong>DeepMind<\/strong> appara\u00eet parmi les \u00e9quipes participantes. D\u00e8s cette session (<strong>CASP13<\/strong>), AlphaFold s\u2019est av\u00e9r\u00e9 plus performant que tous ses concurrents.<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">Lors de <strong>CASP14<\/strong>, en 2020, AlphaFold a surpass\u00e9 toutes les autres \u00e9quipes avec une pr\u00e9cision jamais vue auparavant, atteignant des niveaux comparables aux m\u00e9thodes exp\u00e9rimentales traditionnelles. Ce succ\u00e8s a \u00e9t\u00e9 salu\u00e9 comme une <strong>perc\u00e9e majeure<\/strong> dans le domaine.<\/span><\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-6e7068c elementor-align-center button-principale elementor-widget elementor-widget-button\" data-id=\"6e7068c\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"button.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-button-wrapper\">\n\t\t\t<a class=\"elementor-button elementor-button-link elementor-size-sm elementor-animation-grow\" href=\"https:\/\/datascientest.com\/formation-data-scientist\">\n\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-content-wrapper\">\n\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-text\">Tout apprendre d'AlphaFold<\/span>\n\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-8bc34eb e-flex e-con-boxed e-con\" data-id=\"8bc34eb\" data-element_type=\"container\" data-settings=\"{&quot;content_width&quot;:&quot;boxed&quot;}\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"e-con-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-f4b20c4 elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"f4b20c4\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h3 class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">Comment fonctionne AlphaFold ?<\/h3>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-fd8bec3 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"fd8bec3\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">AlphaFold utilise une combinaison de <a href=\"https:\/\/datascientest.com\/deep-learning-definition\">techniques de deep learning<\/a> et de mod\u00e9lisation structurelle pour pr\u00e9dire les structures prot\u00e9iques. Voici les \u00e9tapes principales du processus:<\/span><\/p><ul><li><b>Entr\u00e9e des donn\u00e9es<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> : La s\u00e9quence lin\u00e9aire d&rsquo;acides amin\u00e9s de la prot\u00e9ine cible est fournie comme entr\u00e9e. <\/span>AlphaFold g\u00e9n\u00e8re des alignements de s\u00e9quences multiples (MSA) pour trouver des s\u00e9quences similaires dans les bases de donn\u00e9es de prot\u00e9ines, fournissant des informations \u00e9volutives.<\/li><li><b>Mod\u00e9lisation<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> : AlphaFold utilise des mod\u00e8les de deep learning, y compris des transformateurs, pour analyser les relations entre les acides amin\u00e9s. Les transformers sont capables de g\u00e9rer les relations longues distances dans les s\u00e9quences, ce qui est crucial pour pr\u00e9dire les interactions entre r\u00e9sidus \u00e9loign\u00e9s dans la s\u00e9quence lin\u00e9aire mais proches dans la structure 3D.<\/span><\/li><li><b>Pr\u00e9diction de distances et d&rsquo;angles<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> : AlphaFold pr\u00e9dit les distances entre les paires d&rsquo;acides amin\u00e9s ainsi que les angles des liaisons chimiques, ce qui aide \u00e0 d\u00e9terminer la forme 3D de la prot\u00e9ine.<\/span><\/li><li><b>Assemblage structurel<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> : En utilisant les pr\u00e9dictions de distances et d&rsquo;angles, AlphaFold assemble la structure tridimensionnelle de la prot\u00e9ine en minimisant une fonction d&rsquo;\u00e9nergie qui p\u00e9nalise les configurations irr\u00e9alistes.<\/span><\/li><li><b>\u00c9valuation de la pr\u00e9diction <\/b><span>: La structure pr\u00e9dite est \u00e9valu\u00e9e pour sa pr\u00e9cision par rapport aux donn\u00e9es exp\u00e9rimentales disponibles, et des techniques de raffinement sont utilis\u00e9es pour am\u00e9liorer la qualit\u00e9 du mod\u00e8le.<\/span><\/li><\/ul>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-df83bea elementor-widget elementor-widget-image\" data-id=\"df83bea\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"image.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<img decoding=\"async\" width=\"900\" height=\"514\" src=\"https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/alphafold-datascientest2.jpg\" class=\"attachment-full size-full wp-image-244586\" alt=\"\" srcset=\"https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/alphafold-datascientest2.jpg 900w, https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/alphafold-datascientest2-300x171.jpg 300w, https:\/\/datascientest.com\/wp-content\/uploads\/2024\/06\/alphafold-datascientest2-768x439.jpg 768w\" sizes=\"(max-width: 900px) 100vw, 900px\" \/>\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-6218fab e-flex e-con-boxed e-con\" data-id=\"6218fab\" data-element_type=\"container\" data-settings=\"{&quot;content_width&quot;:&quot;boxed&quot;}\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"e-con-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-7b71c5b elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"7b71c5b\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h3 class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">Applications de AlphaFold<\/h3>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-3d08ed5 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"3d08ed5\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">En permettant une pr\u00e9diction rapide et pr\u00e9cise des structures prot\u00e9iques, AlphaFold ouvre des perspectives nouvelles pour la recherche biom\u00e9dicale et pharmaceutique. Par exemple :<\/span><\/p><ul><li><b>D\u00e9veloppement de m\u00e9dicaments :<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> La connaissance des structures prot\u00e9iques facilite la conception de m\u00e9dicaments ciblant des prot\u00e9ines sp\u00e9cifiques impliqu\u00e9es dans des maladies.<\/span><\/li><li><b>Biologie synth\u00e9tique :<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> Les scientifiques peuvent concevoir des prot\u00e9ines nouvelles avec des fonctions sp\u00e9cifiques pour des applications industrielles ou environnementales.<\/span><\/li><li><b>Recherche fondamentale :<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> Comprendre la structure des prot\u00e9ines aide \u00e0 \u00e9lucider les m\u00e9canismes biologiques sous-jacents et \u00e0 d\u00e9couvrir de nouvelles cibles th\u00e9rapeutiques.<\/span><\/li><\/ul>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-9027a26 e-flex e-con-boxed e-con\" data-id=\"9027a26\" data-element_type=\"container\" data-settings=\"{&quot;content_width&quot;:&quot;boxed&quot;}\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"e-con-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-33c08e6 elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"33c08e6\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h3 class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">Partage via la base de donn\u00e9es AlphaFold<\/h3>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-cfc32ba elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"cfc32ba\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">AlphaFold s\u2019est engag\u00e9 \u00e0 partager leur technologie AlphaFold avec la communaut\u00e9 des chercheurs. Pour cela, DeepMind a mis en place la base de donn\u00e9es <strong>AlphaFold Protein Structure<\/strong> faite \u00e0 partir des pr\u00e9dictions de AlphaFold.<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">Cette base de donn\u00e9es est <strong>disponible gratuitement<\/strong>, permettant ainsi aux chercheurs du monde entier de consulter et d&rsquo;utiliser ces donn\u00e9es pour leurs propres recherches.<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">Elle contient plus de <strong>350 000 structures dont 20 000 prot\u00e9ines connues du corps humain<\/strong> mais aussi les prot\u00e9omes d\u2019autres organismes importants pour la recherche biologique, dont la levure ou encore la souris.<\/span><\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-98ef467 e-flex e-con-boxed e-con\" data-id=\"98ef467\" data-element_type=\"container\" data-settings=\"{&quot;content_width&quot;:&quot;boxed&quot;}\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"e-con-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-10932ba elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"10932ba\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h3 class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">Conclusion<\/h3>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-7b9ea4c elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"7b9ea4c\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<p><span style=\"font-weight: 400;\">Ainsi, le succ\u00e8s d&rsquo;AlphaFold dans la pr\u00e9diction de la structure des prot\u00e9ines illustre <strong>le potentiel r\u00e9volutionnaire de l&rsquo;intelligence artificielle et du deep learning<\/strong> dans la recherche scientifique.<\/span><\/p><p><span style=\"font-weight: 400;\">Pour en savoir plus sur les technologies de deep learning et vous former aux m\u00e9tiers de la Data, <a href=\"https:\/\/datascientest.com\/formations-data\">rejoignez DataScientest<\/a>.<\/span><\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-91f5c96 elementor-align-center button-principale elementor-widget elementor-widget-button\" data-id=\"91f5c96\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"button.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-button-wrapper\">\n\t\t\t<a class=\"elementor-button elementor-button-link elementor-size-sm elementor-animation-grow\" href=\"https:\/\/datascientest.com\/formation-data-scientist\">\n\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-content-wrapper\">\n\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-button-text\">D\u00e9couvrir la formation Data Scientist<\/span>\n\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-1202cb6 elementor-widget elementor-widget-html\" data-id=\"1202cb6\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"html.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<script type=\"application\/ld+json\">\r\n{\r\n  \"@context\": \"https:\/\/schema.org\",\r\n  \"@type\": \"FAQPage\",\r\n  \"mainEntity\": [{\r\n    \"@type\": \"Question\",\r\n    \"name\": \"Qu'est-ce qu'AlphaFold ?\",\r\n    \"acceptedAnswer\": {\r\n      \"@type\": \"Answer\",\r\n      \"text\": \"AlphaFold est un programme d'intelligence artificielle d\u00e9velopp\u00e9 par DeepMind, une filiale de Google, con\u00e7u pour pr\u00e9dire les structures tridimensionnelles des prot\u00e9ines \u00e0 partir de leurs s\u00e9quences d'acides amin\u00e9s. AlphaFold utilise des algorithmes d'apprentissage profond pour r\u00e9aliser des pr\u00e9dictions tr\u00e8s pr\u00e9cises, ce qui repr\u00e9sente une avanc\u00e9e majeure dans le domaine de la biologie structurelle.\"\r\n    }\r\n  },{\r\n    \"@type\": \"Question\",\r\n    \"name\": \"Pourquoi AlphaFold est-il important pour la recherche scientifique ?\",\r\n    \"acceptedAnswer\": {\r\n      \"@type\": \"Answer\",\r\n      \"text\": \"AlphaFold a r\u00e9volutionn\u00e9 la biologie structurelle en permettant de pr\u00e9dire rapidement et avec une grande pr\u00e9cision la structure des prot\u00e9ines, ce qui \u00e9tait auparavant un processus laborieux et co\u00fbteux. Cette capacit\u00e9 acc\u00e9l\u00e8re la compr\u00e9hension des m\u00e9canismes biologiques, facilite la d\u00e9couverte de nouveaux m\u00e9dicaments, et permet de mieux comprendre les maladies au niveau mol\u00e9culaire.\"\r\n    }\r\n  },{\r\n    \"@type\": \"Question\",\r\n    \"name\": \"Comment fonctionne AlphaFold ?\",\r\n    \"acceptedAnswer\": {\r\n      \"@type\": \"Answer\",\r\n      \"text\": \"AlphaFold utilise des r\u00e9seaux de neurones profonds entra\u00een\u00e9s sur des bases de donn\u00e9es de s\u00e9quences de prot\u00e9ines et de leurs structures connues. Le mod\u00e8le int\u00e8gre des informations sur la proximit\u00e9 des r\u00e9sidus d'acides amin\u00e9s et utilise des techniques d'optimisation pour pr\u00e9dire la structure en minimisant les erreurs. Les pr\u00e9dictions d'AlphaFold sont ensuite affin\u00e9es pour correspondre aux contraintes physiques et chimiques des prot\u00e9ines.\"\r\n    }\r\n  },{\r\n    \"@type\": \"Question\",\r\n    \"name\": \"Quelles sont les applications potentielles d'AlphaFold ?\",\r\n    \"acceptedAnswer\": {\r\n      \"@type\": \"Answer\",\r\n      \"text\": \"Les applications d'AlphaFold sont vastes et incluent la recherche biom\u00e9dicale, la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments, la biotechnologie et la bioing\u00e9nierie. Par exemple, AlphaFold peut aider \u00e0 identifier des cibles th\u00e9rapeutiques pour de nouvelles maladies, \u00e0 concevoir des enzymes pour des applications industrielles, et \u00e0 cr\u00e9er des prot\u00e9ines modifi\u00e9es pour des usages sp\u00e9cifiques en m\u00e9decine et en recherche.\"\r\n    }\r\n  }]\r\n}\r\n<\/script>\r\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Les prot\u00e9ines sont des mol\u00e9cules essentielles \u00e0 la vie, jouant un r\u00f4le crucial dans de nombreux processus biologiques. Elles sont pr\u00e9sentes dans toutes les cellules vivantes et remplissent une multitude de fonctions vitales. Elles sont constitu\u00e9es d&rsquo;acides amin\u00e9s et se d\u00e9ploient dans des structures tridimensionnelles sp\u00e9cifiques qui d\u00e9terminent leur fonction. 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